广州南沙保税物流中心的建设目标是成为立足南沙、依托广州、服务大珠三角乃至泛珠三角、辐射东南亚的国际集装箱枢纽港口物流中心。 广州南沙保税物流中心是国内、国际市场的过渡带，可以利用中心具有“两头在外”的功能和南沙港区的航运资源，实现高效快捷、无障碍贸易和高水平物流服务。中心是封闭的海关监管区域，不仅具备口岸功能，而且是区域经济国际交流的重要平台，拥有国际中转、国际分拨配送、国际采购中心和国际转口贸易四大功能。